Identifikasi Kemiripan Genetik Beberapa Genotipe Saccharum Spp.Sumatera Utara dengan Varietas Tebu Toleran Kekeringan (Ps 864 dan Psjt 941) Menggunakan Penanda Random Amplified Polymorphism Dna

Abstract

Genetic Similarity Identification of North SumatraSaccharum spp. Genotypes withSugarcane Drought-Tolerant Varieties(PS 864 and PSJT 941) Using Random Amplified Polymorphism DNA Marker. Supervised by LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI andLUTHFI A.M SIREGAR. The objectiveof this research was to determine thegenetic similarity ofNorth SumatraSaccharum spp.accessions withsugarcane drought-tolerantvarieties(PS 864andPSJT941).A total of30accessionsof North SumatraSaccharum spp.has been analyzedfor similarity usingRAPDmarker. Fourteendecamer primerswerescreened and tenprimerswere able to amplify DNA template that could producereproductiveDNA fragments. A total 70 polymorphic bands were scored with 10 primers. The number of amplification products per primer ranged from 5(OPN03)to 9(OPA 04, OPC 18, OPD03). Size the amplification products ranged from 196 to 1973 bp. Meanpercentagepolymorphic and PolymorphicInformationContentof10 primers usedwas98,75% and 0,443.Genetic distanceand dendogram formationwere analyzedusing Darwin5.05software. Dicesimilarity coefficientwas usedtoconstruct thedendogram. Based on analysisof geneticdistanceanddendogram,30accessions ofSaccharum spp.North Sumatragroupedinto 3clusters. Genetic distancecoefficients ranged from0,067 (Gambas Hamparan Perak/Gambas Sunggal) to 0,783 (Gelagah Medan Helvetia/Berastagi Sibolangit). PS864andPSJT 941wasin the same cluster. Genetic similarity accession closest with PS 864 was PS 882 and PSJT 941 was Kidang Kencana. The similarity coefficient is 0,828 and 0,787.

Identifikasi Kemiripan Genetik Beberapa Genotipe Saccharum spp.Sumatera UtaraDenganVarietas Tebu Toleran Kekeringan (PS 864 dan PSJT 941) Menggunakan Penanda Random Amplified Polymorphism DNA. Dibimbing oleh LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI dan LUTHFI A.M SIREGAR. Tujuan penelitian adalah untuk mengetahui kemiripan genetik beberapa aksesi Saccharum spp. Sumatera Utara dengan varietas tebu toleran kekeringan (PS 864 dan PSJT 941). Sebanyak 30 aksesi Saccharum spp. Sumatera Utara dianalisis kemiripan genetiknya menggunakan penanda RAPD. Dari 14 primer yang di skrining, 10 primer mampu mengamplifikasi template DNA yang menghasilkan fragmen DNA yang reproduktif. Sebanyak 70 pita polimorfik diskoring dari 10 primer yang digunakan. Jumlah produk amplifikasi per primer berkisar 5 (OPN 03) - 9 (OPA 04, OPC 18, OPD 03). Ukuran produk amplifikasi 196-1973 bp. Rataan persentase polimorphik dan Polymorphic Information Content (PIC) ke-10 primer yang digunakan adalah 98,75% dan 0,454. Jarak genetik dan pembentukan dendogram dianalisis dengan bantuan Software Darwin 5.05. Koefisien kemiripan Dice digunakan untuk membentuk dendogram. Dari hasil analisis jarak genetik dan dendogram, 30 aksesi Saccharum spp. Sumatera Utara dikelompokkan menjadi 3 kelompok. Koefisien jarak genetik berkisar 0,067 (Gambas Hamparan Perak/Gambas Sunggal)-0,783 (Gelagah Medan Helvetia/Berastagi Sibolangit). PS 864 dan PSJT 941 terdapat pada kelompok yang sama. Aksesi yang mempunyai kemiripan genetik paling dekat dengan PS 864 adalah PS 882 dan PSJT 941 adalah Kidang Kencana. Koefisien kemiripan 0,828 dan 0,787.